• Ginti LGS narių socialines, ekonomines bei profesines darbo teises;
• Analizuoti Lietuvos gydytojų statusą, vaidmenį, veiklos kokybę bei visuomenės sveikatos poreikius ir gautą informaciją naudoti savo veikloje;
• Siekti aukštų profesinės veiklos standartų;
• Vystyti medicinos mokslą ir mokymą;
• Įgyvendinti nacionalinę sveikatos koncepciją;
• LGS narių profesinės veiklos tarpusavio santykius reguliuoti pagal profesinės etikos reikalavimus;
• Atstovauja LGS narių profesiniams interesams bei teisėms santykiuose su darbdaviais, kitais juridiniais ir fiziniais asmenimis;
• Sudaro su darbdaviais kolektyvines darbo sutartis bei susitarimus ir kontroliuoja jų vykdymą;
• Kontroliuoja, kaip darbdaviai vykdo su LGS narių teisėmis bei interesais susijusius darbo, ekonomikos ir socialinius įstatymus;
• LGS miestų (rajonų) filialams teikia materialinę, organizacinę ir kitokio pobūdžio pagalbą;
• Organizuoja gydytojų tobulinimosi kursus, simpoziumus, konferencijas ir kt.;
• Dalyvauja gydytojų licencijavime įstatymo nustatyta tvarka;
• Nagrinėja ir svarsto LGS narių profesinės etikos pažeidimus;
• Analizuoja valstybės ir savivaldos institucijų informaciją apie visuomenės sveikatos priežiūrą, dalyvauja rengiant įstatymus ir kitus teisės aktus;
• leidžia vienkartinius ir periodinius leidinius;
• Bendradarbiauja su kitomis profesinėmis sąjungomis ir susivienijimais, užsienio šalių ir tarptautinėmis gydytojų organizacijomis, dalyvauja rengiant ir įgyvendinant tarptautines programas;
• Dalyvauja rengiant sveikatos priežiūros paslaugų kainyną;
• Periodiškai atlieka gydytojų darbo apmokėjimo analizę ir teikia pasiūlymus, susijusius su gydytojų darbo apmokėjimu, Privalomojo sveikatos draudimo fondo tarybai, Sveikatos apsaugos ministerijai, Valstybinei ligonių kasai.